Первый клон, который появляется как в «Индексе волшебства», так и в «Неком научном Рейлгане». Поначалу у неё нет значительной роли в «Индексе волшебства», однако её характер впоследствии был раскрыт в «Неком научном Рейлгане». Серийный номер — 10031. Первый клон, с которым встречается Тома. Как и остальных клонов, её не отличить от оригинала, и у неё также отсутствуют эмоции, так как они не были полезны для эксперимента. Несмотря на это, всё ещё чувствует боль. Кроме того у Мисаки 10031 имеются задатки личности, которые проявляются в её упрёках в сторону Мисаки и Томы, когда те «ограбили» торговый автомат. Мисака 10031 опечалена тем фактом, что они на такое способны, и со всей серьёзностью перечитывает все правовые статьи о том, какое они совершают «уголовное преступление».
Спойлер
Как и все клоны, участвовала в проекте «Достижение шестого уровня». Во время эксперимента отчаянно билась против Акселератора, но, как и всех остальных, её ждало поражение. Выбившись из сил, не смогла продолжать бой. Именно в этом бою Акселератор придумывает новый способ использования своей силы, заключающийся в управлении биоэлектричеством — «Инверсия крови». В результате чего Мисака 10031 моментально умирает. Становится последним клоном, который погибает в эксперименте.
